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易基因:EP/IF7.3:陸軍軍醫(yī)大學劉晉祎團隊揭示PM2.5暴露通過m6A甲基化調控雄性生殖功能損傷機制|項目文章

日期:25-08-18

近日,陸軍軍醫(yī)大學軍事預防醫(yī)學系王建康博士和張中豪博士為并列第一作者、劉晉祎教授為唯一通訊作者,在《Environmental Pollution》期刊上發(fā)表了題為“WTAP-mediated m6A modification of Hmgb2 contributes to spermatogenic damage induced by PM2.5 exposure”的研究論文。研究主要從m6A修飾角度揭示了PM2.5暴露對雄性生殖功能損傷的作用及其潛在機制。作者通過建立實時PM2.5暴露的小鼠模型和GC-2spd細胞系,發(fā)現(xiàn)PM2.5暴露會導致精子發(fā)生上皮損傷、精子運動能力下降,并且通過改變睪丸組織中m6A修飾圖譜,尤其是影響Hmgb2基因的m6A修飾,進而影響精子發(fā)生相關基因的表達,最終導致精子活力降低。該研究不僅為理解PM2.5對男性生殖健康的危害提供新視角,還為未來開發(fā)靶向環(huán)境污染導致生殖損傷的干預措施提供了理論依據(jù)。深圳易基因為本研究提供所需的m6A甲基化測序(MeRIP-seq)技術服務,助力揭示PM2.5暴露對雄性生殖健康影響的關鍵機制。

標題:WTAP-mediated m6A modification of Hmgb2 contributes to spermatogenic damage induced by PM2.5 exposureWTAP介導的Hmgb2 m6A修飾促進PM2.5暴露誘導的精子發(fā)生損傷)

發(fā)表時間:202541

發(fā)表期刊:Environmental Pollution

影響因子:IF7.3/Q1

技術平臺:MeRIP-seqRNA-seq等(易基因金牌技術

作者單位:陸軍軍醫(yī)大學軍事預防醫(yī)學系王建康、張中豪、劉晉祎等

doi: 10.1016/j.envpol.2025.125896

 

N6-甲基腺苷(m6A)廣泛參與復雜的精子發(fā)生過程,同時對環(huán)境暴露極為敏感。眾多研究表明,細顆粒物(PM2.5)對男性生殖系統(tǒng)具有毒性,但其中涉及的具體表觀遺傳機制尚未得到充分研究。本研究通過構建實時PM2.5暴露的小鼠模型和GC-2spd細胞系,研究了m6A修飾對PM2.5誘導的男性生殖功能障礙的影響。結果表明,PM2.5暴露導致小鼠精子發(fā)生上皮受損、精母細胞線粒體異常以及精子運動能力顯著下降。MeRIP-seq基因富集分析結果表明,與對照組相比,經(jīng)PM2.5處理的小鼠睪丸組織中差異m6A修飾基因在精子發(fā)生過程中顯著富集,且甲基轉移酶WTAP表達在PM2.5暴露后顯著降低。此外,PM2.5暴露導致精子發(fā)生相關基因Hmgb2表達以及Hmgb2 m6A修飾水平顯著降低。轉錄組測序(RNA-seq)及驗證實驗表明,Hmgb2可能調控精母細胞中的ATP(腺苷三磷酸)水平。研究還證實m6A甲基轉移酶WTAP通過m6A修飾影響Hmgb2 mRNA穩(wěn)定性。本研究為理解PM2.5對精子發(fā)生損害以及精子運動能力降低提供了新見解。


研究圖形摘要

 

易小結

本研究通過MeRIP-Seq技術揭示了PM2.5暴露對雄性生殖功能的損傷機制,特別是m6A修飾在調控Hmgb2基因表達中的關鍵作用,為理解環(huán)境污染對生殖健康的表觀遺傳調控提供了重要依據(jù)。

這一發(fā)現(xiàn)不僅強調了m6A修飾在環(huán)境健康研究中的重要性,也為易基因的表觀基因組技術提供了新的應用場景。易基因作為領先的多組學解決方案提供商,擁有先進的表觀遺傳檢測技術,能夠為類似研究提供從樣本處理到數(shù)據(jù)分析的一站式服務,助力科學家深入探索環(huán)境因素對生物體的表觀遺傳影響。

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研究方法

動物實驗:8周齡實驗小鼠隨機分為三組,分別暴露于高濃度環(huán)境顆粒物(CAP,483.6μg/m3、正常環(huán)境未過濾空氣(UA59.8μg/m3過濾空氣(FA,0.4μg/m3中,每組8只小鼠。暴露結束后,對小鼠睪丸進行組織學檢查、精子運動能力檢測、超微結構觀察等。

細胞實驗:使用小鼠來源的精母細胞(GC-2spd體外細胞系)進行細胞實驗,將 PM2.5標準物質SRM1648a制備PM2.5股溶液(5mg/mL),選擇 0、25、50100μg/mL 四個濃度的 PM2.5進行細胞實驗。

基因敲低與過表達:分別對WtapHmgb2進行過表達和敲低操作。

轉錄組測序Hmgb2敲低的GC-2spd 細胞進行轉錄組測序(RNA-seq),分析RNA表達變化。

MeRIP-Seq對睪丸組織的m6A RNA免疫沉淀測序,檢測不同組暴露小鼠的m6A甲基化水平變化。

特定位點m6A修飾檢測(MeRIP - qRT - PCR):根據(jù) MeRIP-Seq結果設計特異性引物進行 qRT - PCR 檢測特定位點 m6A修飾水平。

 

結果圖形

1PM2.5暴露導致精子細胞損傷和精子運動能力下降

研究者構建了實時PM2.5暴露的小鼠模型,通過組織學檢查發(fā)現(xiàn)PM2.5暴露導致小鼠精子發(fā)生上皮受損,表現(xiàn)為增加的空泡化和精子細胞排列紊亂(圖1A)。對VII期精子發(fā)生小管中的細胞計數(shù)顯示,PM2.5暴露后,粗線期精母細胞數(shù)量顯著減少,而精原細胞和圓形精子數(shù)量雖有下降趨勢,但差異未達到統(tǒng)計學意義,支持細胞數(shù)量未發(fā)生顯著變化(圖1B-E)。超微結構觀察顯示,PM2.5暴露后,精母細胞線粒體受損,表現(xiàn)為線粒體嵴減少和外膜破裂(圖1F),提示精母細胞是PM2.5暴露的關鍵靶細胞。此外,通過計算機輔助精子分析系統(tǒng)(CASA)分析小鼠精子運動能力,與過濾空氣(FA)組相比,正常環(huán)境(UA)組精子運動能力相關參數(shù)(總精子運動能力、超激活、PRVSL)呈現(xiàn)下降趨勢,但差異未達到統(tǒng)計學意義,而高濃度環(huán)境顆粒物(CAP)組所有參數(shù)均顯著下降(圖1G-J)。這些結果表明PM2.5暴露對小鼠精子發(fā)生和運動能力產(chǎn)生了明顯負作用。

1PM2.5暴露導致小鼠精子發(fā)生上皮損傷和精子運動能力下降。

(A)    睪丸組織HE染色切片的代表性圖像。

(B-E) VII期精子發(fā)生小管中的精子細胞計數(shù),包括精原細胞(B)、粗線期精母細胞(C)、圓形精子(D)和Sertoli細胞(E)(n=8)。

(F)  睪丸超微結構的代表性圖像。紅色箭頭線:受損的線粒體(嵴減少和外膜破裂)。

(G-J) 通過CASA測量的精子運動能力相關參數(shù),包括總精子運動能力(G)、前向運動能力(PR,H)、直線速度(VSLI)和精子超活化(J)(n=8)。

 

2PM2.5暴露誘導睪丸m6A甲基化圖譜變化

為深入了解m6A修飾在PM2.5誘導的雄性生殖損傷中的作用,研究者對睪丸組織細胞中的RNA m6A進行高通量測序(MeRIP-seq)。在FA組中,m6A修飾基因主要在精子發(fā)生、精子與透明帶結合以及精子細胞發(fā)育等過程中富集,表明m6A修飾在正常雄性生殖過程中發(fā)揮功能(圖2A)。進一步分析差異甲基化區(qū)域(DMRs,P<0.05),結果表明與FA組相比,CAP組有152個顯著上調甲基化區(qū)域和105個顯著下調甲基化區(qū)域,而UA組與FA組之間有298個上調區(qū)域和85個下調區(qū)域(圖2B)。這些DMRs主要位于mRNA結構的CDS3'UTR區(qū)域(圖2C)。對DMRsmotif分析顯示,CAP組和FA組的DMRs主要出現(xiàn)在HGACCmotif中,而UA組和FA組的DMRs主要出現(xiàn)在HCGAHmotif中(圖2D)。對CAP、UAFA組中差異m6A修飾基因的功能富集分析顯示,精子發(fā)生過程顯著富集(圖2EF)。這些結果表明m6A修飾可能參與PM2.5誘導的雄性生殖損傷過程。MeRIP-Seq技術在這一部分發(fā)揮關鍵作用,其對RNA上的m6A修飾進行高通量測序,從而全面揭示PM2.5暴露后睪丸組織中m6A修飾的整體變化情況,為后續(xù)尋找關鍵靶基因提供基礎。


2CAPUAFA組睪丸轉錄組范圍內(nèi)的差異m6A甲基化特征。

(A) FA組中m6A修飾基因的基因本體(GO)富集分析。

(B) 差異m6A修飾peaks分析。

(C) 差異甲基化區(qū)域(DMRs)在mRNA上的分布模式。

(D) DMRsmotif分析。(R=A/G,H=A/C/U

(E-F) CAP組與FA組(E)以及UA組與FA組(F)中不同m6A修飾基因的生物過程富集分析。

 

3Hmgb2是一個關鍵的差異表達m6A修飾精子發(fā)生相關基因

研究者進一步分析了FA、UACAP組之間的差異m6A修飾精子發(fā)生相關基因的交集,共鑒定出10個潛在關鍵基因(Hmgb2、Tdrd5、Hspa1l、Bag6、SetxPax5、Map7、Dnm2、Chd5Piwil1)。對這些基因在小鼠睪丸中的mRNA表達水平進行驗證分析,結果表明Hmgb2Piwil1PM2.5暴露小鼠睪丸中顯著下調,而Tdrd5顯著上調(圖3A)。在GC-2spd細胞中存在類似結果(圖3B)。HMGB2蛋白在PM2.5暴露小鼠睪丸中的表達顯著降低(圖3CD),但在體外模型中,HMGB2蛋白水平在PM2.5處理后也顯著下調(圖3EF)。MeRIP-Seq結果顯示,PM2.5暴露后睪丸組織中Hmgb2m6A修飾減少(圖3G),這一結果在體外模型中也得到進一步驗證(圖3H)?;谶@些數(shù)據(jù),研究者將關注點聚焦于Hmgb2基因。MeRIP-Seq不僅能夠檢測到Hmgb2基因m6A修飾變化,還精確定位修飾發(fā)生的具體區(qū)域,為后續(xù)研究Hmgb2基因m6A修飾的功能提供重要依據(jù)。

3PM2.5暴露后GC-2spd細胞和睪丸中Hmgb2表達下調。

(A-B) 小鼠睪丸(A)和GC-2spd細胞(B)中10個關鍵差異m6A修飾的精子發(fā)生相關基因mRNA表達(n=3)。

(C)  小鼠睪丸中HMGB2蛋白的表達。

(D)  小鼠睪丸中HMGB2蛋白水平的定量分析(n=3)。

(E)  GC-2spd細胞中HMGB2蛋白的表達。

(F)  細胞中HMGB2蛋白水平的定量分析(n=3)。

(G)  小鼠睪丸中Hmgb2 mRNA甲基化峰的可視化。

(H)通過MeRIP-qRT-PCR檢測PM2.5暴露對GC-2spd細胞中Hmgb2 m6A修飾的作用(n=3)。

 

4Hmgb2下調介導小鼠精子發(fā)生細胞中的ATP水平變化

Hmgb2在精子發(fā)生和精子運動能力中的具體功能尚不清楚。研究者構建了Hmgb2敲低的GC-2spd細胞系并進行RNA-seq轉錄組測序,共鑒定出199個差異表達基因(DEGs),包括145個上調基因和54個下調基因(圖4C)。對這些DEGs進行通路富集分析發(fā)現(xiàn),氧化磷酸化通路顯著富集,GO富集分析顯示線粒體呼吸鏈復合體I顯著富集(圖4DE)。這些結果表明Hmgb2可能參與精子發(fā)生細胞中的ATP合成。ATP水解是真核細胞中代謝能量的主要來源,ATP檢測試驗顯示Hmgb2敲低后細胞內(nèi)ATP水平降低(圖4F)。進一步實驗結果表明,PM2.5暴露的GC-2spd細胞中ATP水平降低(圖4G)。通過qRT-PCR驗證轉錄組富集的氧化磷酸化基因在Hmgb2敲低和PM2.5處理的GC-2spd細胞中的表達確實受到干擾。研究者驗證了PM2.5誘導的ATP降低可以通過過表達Hmgb2來逆轉(圖4HI)。這些數(shù)據(jù)表明Hmgb2可能調控精子發(fā)生細胞中的ATP水平,從而影響精子運動能力。

4Hmgb2調控GC-2spd細胞中的ATP水平。

(A-B) 對照組和轉染siHMGB2的細胞中HMGB2蛋白的表達及定量分析(n=3)。

(C)  GC-2spd細胞轉染siHMGB2后轉錄組測序結果的火山圖。

(D)  RNA-seq中差異表達基因的KEGG分析圖。

(E)  RNA-seqGO富集分析結果。

(F)  siHMGB2處理后GC-2spd細胞中的ATP水平。

(G)  PM2.5暴露后細胞中的ATP水平。

(H)  HMGB2-OE質粒處理后的HMGB2蛋白表達。

(I)   有無PM2.5處理時,HMGB2-OE質粒處理后GC-2spd細胞中的ATP水平。

 

5PM2.5誘導的m6A修飾可能主要由m6A甲基轉移酶WTAP下調引起

差異m6A修飾受m6A甲基轉移酶和去甲基轉移酶調控。為探索PM2.5暴露小鼠雄性生殖系統(tǒng)中m6A甲基轉移酶和去甲基轉移酶是否差異表達,研究者檢測了甲基轉移酶(METTL3、METTL4WTAP)和去甲基轉移酶(FTOALKBH5)的mRNA表達。結果表明,PM2.5暴露小鼠睪丸中m6A甲基轉移酶WTAP表達顯著降低,而PM2.5m6A去甲基轉移酶mRNA表達無影響(圖5A)。在PM2.5暴露的GC-2spd細胞中也得到一致結果(圖5B)。此外,WTAP蛋白在PM2.5暴露的睪丸組織和GC-2spd細胞中的表達顯著降低(圖5C-F)。同時,WTAP蛋白與Hmgb2 mRNA之間存在很高的互作概率。

5PM2.5暴露后GC-2spd細胞和睪丸中m6A甲基轉移酶和去甲基轉移酶的表達檢測。

(A-B) 小鼠睪丸(A)和GC-2spd細胞(B)中甲基轉移酶和去甲基轉移酶的mRNA表達(n=3)。

(C)  小鼠睪丸中WTAP蛋白的表達。

(D)  小鼠睪丸中WTAP蛋白的定量分析(n=3)。

(E)  GC-2spd細胞中WTAP蛋白的表達。

(F)  GC-2spd細胞中WTAP蛋白的定量分析(n=3)。

 

6WTAP通過m6A修飾調控PM2.5誘導的Hmgb2表達降低

接下來,研究者進一步確認Hmgb2表達是否受甲基轉移酶WTAP的調控。首先通過RNA免疫沉淀實驗(RIP)結果表明,與陰性對照IgG相比,抗WTAP抗體在Hmgb2中顯著富集(圖6A),表明WTAP蛋白與Hmgb2 mRNA之間存在互作。使用siRNA敲低Wtap后,GC-2spd細胞中Hmgb2 mRNA表達顯著降低,蛋白表達驗證結果也一致(圖6B-D)。為研究m6A修飾的具體調控作用,研究者進行MeRIP-qRT-PCR實驗。根據(jù)MeRIP-Seq結果設計特異性引物,發(fā)現(xiàn)敲低Wtap導致Hmgb2m6A修飾水平降低(圖6E)。進一步構建過表達Wtap的細胞系,結果顯示過表達WtapGC-2spd細胞中Hmgb2m6A修飾顯著提高(圖6F)。研究者還證明PM2.5誘導的Hmgb2降低可以通過過表達Wtap來逆轉(圖6GH)。為驗證Wtap是否通過m6A修飾調控Hmgb2 mRNA穩(wěn)定性,研究者進行RNA穩(wěn)定性實驗。結果表明敲低Wtap加速Hmgb2 mRNA降解(圖6I)。總體而言,這些結果表明PM2.5誘導的Hmgb2低表達是由于WTAP通過m6A修飾調控的Hmgb2 mRNA穩(wěn)定性降低所致。


6WTAP通過m6A修飾調控Hmgb2 mRNA的穩(wěn)定性。

(A) 通過RNA免疫沉淀(RIP)分析WTAP蛋白與Hmgb2 mRNA的互作(n=3)。

(B) 轉染siWTAPGC-2spd細胞中WtapHmgb2 mRNA表達的驗證(n=3)。

(C) siWTAP處理后細胞中WTAPHMGB2蛋白的表達。

(D) siWTAP處理后WTAPHMGB2蛋白表達的定量分析(n=3)。

(E) siWTAP-3處理對GC-2spd細胞中Hmgb2m6A修飾的影響(n=3)。

(F) Wtap過表達后GC-2spd細胞中Hmgb2m6A修飾水平(n=3)。

(G) 有無PM2.5處理時,對照組和WTAP-OEGC-2spd細胞中WTAPHMGB2蛋白的表達水平。

(H) WTAPHMGB2蛋白的定量分析(n=3)。

(I) siNC組相比,有無siWTAP處理時GC-2spd細胞中Hmgb2 mRNA的穩(wěn)定性(n=3)。

 

結論和啟示

本研究從m6A修飾的表觀遺傳學角度為理解PM2.5的雄性生殖毒性提供了新的視角。PM2.5暴露后,m6A甲基轉移酶WTAP表達降低,導致Hmgb2 mRNA穩(wěn)定性降低(通過降低Hmgb2m6A修飾),進而影響精子發(fā)生細胞中的ATP水平,最終導致精子運動能力下降。本研究揭示了PM2.5暴露導致小鼠精子發(fā)生上皮受損和精子運動能力下降的現(xiàn)象,并闡明了m6A修飾在PM2.5暴露導致的精子發(fā)生細胞損傷中的作用。

MeRIP-Seq在本研究中的作用

本研究通過MeRIP-Seq技術全面揭示了PM2.5暴露對睪丸組織m6A修飾的影響,并進一步通過實驗驗證了關鍵基因Hmgb2m6A修飾變化及其功能。這一發(fā)現(xiàn)提示,在未來類似的污染環(huán)境暴露研究中,m6A修飾檢測技術(如MeRIP-Seq)可以作為一種強有力的工具,用于探索環(huán)境因素對生物體基因表達和生理功能的影響機制,為開發(fā)靶向干預措施提供理論依據(jù)。

 

參考文獻:

Wang J, Zhang Z, Shi F, Li Y, Shi C, Wang T, Sun L, Ao L, Han F, Chen Q, Cao J, Liu J. WTAP-mediated m6A modification of Hmgb2 contributes to spermatogenic damage induced by PM2.5 exposure. Environ Pollut. 2025 Feb 21:125896. doi: 10.1016/j.envpol.2025.125896.