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羥甲基化-靶基因甲基化/羥甲基化測序(Target-oxBS+Target-BS)

靶基因亞硫酸鹽高通量測序(Target Bisulfite sequencing,Target(- ox)BS)是針對已有目標基因panel組合,運

易基因自主研發(fā)的甲基化特異性多重PCR引物設計軟件,對亞硫酸鹽轉化或氧化亞硫酸鹽轉化后的目標基因多重

擴增,建庫后進行超高深度(1000X以上)甲基化精準檢測。


技術優(yōu)勢

1. 超高深度亞硫酸鹽甲基化測序,檢測準確性極高,完勝傳統BSP測序

2. 檢測靈敏度高,可準確檢測到樣本中低于1%的甲基化水平

3. 樣本需求量低,20ng基因組DNA可實現多基因擴增

4. 檢測費用顯著低于現有技術、快周期、超高性價比

5. 平行化學氧化后亞硫酸鹽測序,甲基化和羥甲基化精準檢測

6. 適用范圍廣,對基因組DNA、FFPE樣本、游離cfDNA等樣本均適用

7. 實現近百個基因的多重擴增,檢測通量高,優(yōu)于焦磷酸甲基化測序


實驗策略


信息分析



技術參數




研究案例

靶基因DNA甲基化測序驗證補充維C可減少后代因母親妊娠期吸煙而發(fā)生的DNA甲基化變化

Vitamin C Prevents Offspring DNA Methylation Changes Associated with Maternal Smoking in Pregnancy


1、背景:

妊娠期吸煙可能導致嬰兒出生后終生肺功能下降。此前已有不少研究描述了孕婦吸煙相關的的DNA甲基化變化,如在分娩時的胎盤和臍血、

胎兒肺以及兒童時期的口腔上皮和血液中。本研究為確定補充維生素 C 是否會減少后代因母親因妊娠期吸煙而發(fā)生的甲基化變化。

2、方法:

對胎盤、臍帶血樣本和口腔樣本進行靶向重亞硫酸鹽測序,然后使用靶基因DNA甲基化測序對選定的臍帶血差異甲基化區(qū)域進行獨立驗證。

3、結論:

安慰劑組和非吸煙者組之間甲基化差異≥10%的大多數CpG(69.03%)在補充維生素C后,至少50%可恢復到非吸煙者水平?;謴偷腃pG中

有相當一部分與低甲基化CpG富集程度較高的表型結果相關。

Target(- ox)BS用于甲基化多位點甲狀腺結節(jié)診斷


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表觀技術 | 靶基因DNA甲基化和羥甲基化測序 定制精準檢測