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m6A甲基化-常規(guī)mRNA 甲基化測序（MeRIP）
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m6A甲基化-常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序（lnc-MeRIP）
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m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化測序（Micro- lnc-MeRIP）
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m5C甲基化-常規(guī)mRNA 甲基化測序（RNA-BS）
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m5C甲基化-常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序（lncRNA-BS）
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m5C RNA甲基化測序（m5C MeRIP-seq）
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m1A 甲基化常規(guī)mRNA甲基化測序（MeRIP）
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m1A甲基化常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序（ lnc MeRIP）
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m1A甲基化微量mRNA +lncRNA甲基化測序（ Micro lnc MeRIP）
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m7G甲基化常規(guī)mRNA甲基化測序（ MeRIP）
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m7G甲基化常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序（ lnc MeRIP）
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m7G甲基化微量mRNA+lncRNA甲基化測序（ Micro lnc MeRIP）
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RNA甲基化液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜法 (LC-MS/MS)
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ac4C乙?；疪NA免疫沉淀測序（acRIP-seq）
ac4C乙?；疪NA免疫沉淀測序（acRIP-seq）
ac4C RNA乙酰化（N4-acetyicytidine，ac4C），N4位乙酰胞嘧啶，是真核原核生物中保守的化學(xué)修飾，早期研究認為ac4C主要存在于tRNA和18S rRNA上。近期研究顯示，mRNA上也存在大量的ac4C，該修飾在促進蛋白翻譯、影響RNA穩(wěn)定性和可變剪接、調(diào)控基因表達發(fā)揮重要作用，是繼m6A修飾之后表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)的新興發(fā)展方向。
ac4C RNA修飾的檢測，易基因采用基于抗體富集的ac4C RNA乙?；庖吖渤恋?(acetylated RNA Immunoprecipitation，acRIP)技術(shù)：基于抗體特異性結(jié)合乙?；揎棄A基原理，以RNA免疫共沉淀富集乙?；揎椘螢榛A(chǔ)，然后通過高通量測序（acRIP-seq），在轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)研究發(fā)生乙?；腞NA區(qū)域，高效獲得結(jié)果。
易基因提供適用于不同科研需求的acRIP -seq技術(shù)：
1）ac4C 乙?；?常量mRNA acRIP -seq
2）ac4C 乙?；?常量mRNA +lncRNA acRIP -seq
3）ac4C 乙酰化-微量mRNA +lncRNA acRIP -seq
實驗原理：
首先通過poly(A)捕獲RNA，將獲得的RNA打成100nt左右的小片段；之后使用ac4C特異性抗體進行免疫共沉淀，含有ac4C修飾的RNA片段被富集并回收；進而對回收的RNA進行文庫構(gòu)建、高通量測序和生物信息學(xué)分析，通過peak分析鑒定出ac4C修飾的位點。
實驗策略：
信息分析：
送樣要求：
研究案例：
mRNA中胞嘧啶核苷乙?；商岣叻g效率
Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency
期刊：Cell
IF：45.5
N4-乙酰胞嘧啶（ac4C）是一種由乙酰轉(zhuǎn)移酶NAT10催化的mRNA修飾。本研究通過對WT和下調(diào)NAT10的Hela細胞進行acRIP-seq和mRNA-seq，揭示了ac4C在編碼序列中的特異性乙?；瘏^(qū)域富集。NAT10敲除導(dǎo)致在比對mRNA位點的ac4C檢測減少，并與靶向mRNA整體下調(diào)相關(guān)。對mRNA半衰期分析顯示，乙?；痬RNA穩(wěn)定性依賴于NAT10。進一步實驗表明，mRNA乙酰化在體內(nèi)外增強底物翻譯。在ac4C peaks的密碼子含量分析揭示了在動態(tài)位點中胞嘧啶的偏倚表達，從而影響mRNA解碼效率。這些發(fā)現(xiàn)擴展了mRNA修飾范圍（包括乙?；瘹埢㈥U明了ac4C在mRNA翻譯調(diào)控中的作用。
acRIP-seq繪制mRNA ac4C圖譜
參考文獻：
以上就是關(guān)于ac4C乙酰化RNA免疫沉淀測序（acRIP-seq）技術(shù)的介紹，易基因科技提供全面的表觀遺傳學(xué)研究整體解決方案，有需要的老師可以通過以下方式聯(lián)系我們。
0755-28317900 / 18124167839
